Жапарханов С.Ж. родился 25 августа 1927 года в ауле Караш Чарского района Семипалатинской области. С 1944 по 1948 гг. учился в геолого-разведочном техникуме, затем в КазГМИ, после окончания которого в 1953 году 6 лет работал на производстве, в геологических партиях и экспедициях. Является первооткрывателем 7 месторождений подземных минеральных вод.
С апреля 1962 года после успешной защиты кандидатской диссертации работал в Институте геологических наук АН КазССР старшим научным сотрудником, а в мае 1964 года Президиум АН КазССР утвердил его в должности ученого секретаря ИГН АН КазССР. В 1966 году был избран на должность заведующего сектором гидродинамики подземных вод. В июне 1986 года переведен на работу в КазПТИ им. В.И. Ленина на должность заведующего кафедрой гидрогеологии и инженерной геологии.
Результаты многолетней научно-исследовательской работы по подземным водам основных горнорудных районов Центрального Казахстана были успешно защищены в докторской диссертации в 1974 году.
Жапарханов С.Ж. с 1964 года- член ученых советов ИГН им К.И. Сатпаева и ИГиГ им. У.М. Ахмедсафина АН КазССР, с 1977 - специализированного совета по кандидатским диссертациям в АН КазССР, а с 1984 - докторского- по республикам Средней Азии и Казахстана, в Ташкенте. С 1977 года входил в состав Государственной комиссии по опреснению вод при ГКНТ СССР, с 1984 года был зам. председателя секции Комитета по Государственным премиям в области науки и техники.
Он постоянный внештатный общественный корреспондент Казтелерадио. В 1980 году он был удостоен высокого звания Лауреата Государственной премии КазССР в области науки и техники.
Жапарханов С.Ж. является одним из ведущих ученых-гидрогеологов. Как руководитель научной школы он создал и более 30 лет возглавляет научное направление по горнорудной гидрогеологии в Казахстане. Под его руководством успешно защищены 2 докторских и 20 кандидатских диссертаций. В 1983 году ему присвоено звание профессора. За активную научно-педагогическую деятельность и организаторскую работу многократно имел благодарности, поощрялся премиями, Почетными Грамотами. В 1970, 1976, 1985, 1995 годах награжден медалями СССР. Является действительным членом Международной академии информатизации и руководит секцией "Геоинформационные технологии".
Жапарханов С.Ж.- участник многих Международных научных съездов, конгрессов, симпозиумов. В 1992 году по приглашению ЮНЕСКО он прочитал цикл лекций в МГУ им. М.В.Ломоносова ученым-стипендиатам дальнего зарубежья по водным ресурсам Казахстана.
За время инженерной, научной и педагогической деятельности им опубликовано более 200 работ, в т.ч. 19 монографий, 11 карт, 150 научно-методических и 75 популярных статей.
С 1991 года, как профессор кафедры гидрогеологии и инженерной геологии КазНТУ, проводит большую научно-педагогическую и воспитательную работу среди студентов и коллектива кафедры.